《蓝色乐章》系列的第一章讲述了吉弘和松永经过东洋学园，来到海边的暑期学校时，对暑期学校的各种事件的回忆，相遇和分离交织的命运。一个神秘的女孩微笑着看着站在海边的黄昏里一动不动的吉郎。

《蓝色乐章》系列的第二章主要讲述了森泽直男和松永义裕对过去的感情无法释怀的去年夏令营事件。

在《蓝色乐章》系列的最后一章，松永义宏和森泽直男之间的感情更加强烈，而义宏最终在第一章找到了神秘女孩的身份。